23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4236 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4236  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  41.38 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0749  hypothetical protein  40.24 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556713  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3372  hypothetical protein  42.42 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2446  hypothetical protein  64.86 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.644391  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  49.06 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  36.05 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  31.71 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4925  hypothetical protein  36.92 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1885  hypothetical protein  41.27 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1626  hypothetical protein  44.83 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  45 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  41.82 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2173  hypothetical protein  41.38 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2313  hypothetical protein  33.9 
 
 
94 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  32.99 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  40.91 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  27.55 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0007  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0286  hypothetical protein  52.78 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1940  hypothetical protein  39.58 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2548  hypothetical protein  40.91 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>