14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4140 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4140  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  48.21 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0748  hypothetical protein  30.56 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1885  hypothetical protein  30 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  43.48 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3372  hypothetical protein  32.22 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0749  hypothetical protein  29.87 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556713  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2859  hypothetical protein  34.78 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339127  normal  0.413255 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  28.85 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  30.38 
 
 
108 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1626  hypothetical protein  29.67 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1262  hypothetical protein  32.65 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>