48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5112 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  69.16 
 
 		 234 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  70.09 
 
 		 231 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  67.4 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  66.96 
 
 		 234 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  66.52 
 
 		 234 aa  314  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  67.12 
 
 		 231 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  54.41 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  53.43 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  31.19 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  37.64 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.11 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  29.86 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  31.35 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  28.97 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  29.12 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  28.5 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  31.64 
 
 		 258 aa  88.6  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5553  hypothetical protein  35.98 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  33.08 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.21 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0211  hypothetical protein  35.71 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0393  Lipoate-protein ligase A-like protein  33.54 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.54 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2112  hypothetical protein  31.46 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.46 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.09 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.27 
 
 		 274 aa  52  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  23.53 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  23.53 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  23.53 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  23.53 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  23.53 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  23.53 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  23.53 
 
 		 281 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  23.53 
 
 		 281 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  24.56 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.56 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.41 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.42 
 
 		 329 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.68 
 
 		 281 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  27.22 
 
 		 326 aa  45.4  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  28.77 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  23.64 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  23.64 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4582  Lipoate-protein ligase A-like protein  26.82 
 
 		 261 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  24 
 
 		 325 aa  41.6  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>