36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1694 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  489  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  86.75 
 
 		 235 aa  425  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  58.44 
 
 		 236 aa  289  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  56.77 
 
 		 236 aa  281  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  33.18 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  34.5 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  31.37 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  31.82 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  28.12 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  28.38 
 
 		 234 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  28.38 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  28.7 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  28.05 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  29.28 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  28.5 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  29.19 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.94 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5553  hypothetical protein  27.51 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  29.38 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.81 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.47 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.16 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  24.24 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  28.09 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  28.09 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  21.92 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  21.92 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  21.92 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  21.92 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  21.92 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  21.92 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.21 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  27.78 
 
 		 279 aa  42.4  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.97 
 
 		 281 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  21.23 
 
 		 281 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  26.97 
 
 		 281 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>