26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0257 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  86.75 
 
 		 236 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  58.15 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  56.19 
 
 		 236 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  36.26 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  32.67 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  30.04 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  30.04 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  29.6 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  30.7 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  31.22 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  31.39 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  29.96 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  28.97 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  30.81 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.4 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5553  hypothetical protein  31.02 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  30.77 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.17 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.78 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.57 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  31.76 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  27.78 
 
 		 278 aa  45.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  27.78 
 
 		 278 aa  45.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  28.71 
 
 		 279 aa  42.4  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>