40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0237 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  100 
 
 		 279 aa  581  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  82.31 
 
 		 278 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  82.31 
 
 		 278 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  53.7 
 
 		 278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  51.26 
 
 		 281 aa  278  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  50.9 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  50.9 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  50.9 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  50.9 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  50.9 
 
 		 281 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  50.54 
 
 		 281 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  50.54 
 
 		 281 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  50.18 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  50.19 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  49.82 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  46.64 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  37.76 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.44 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.71 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10550  lipoate-protein ligase A  23.33 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  29.67 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  26.67 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  26.05 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  24.24 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  27.18 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  24.85 
 
 		 236 aa  49.3  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.03 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  23.86 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  24.3 
 
 		 231 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  26.85 
 
 		 231 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5000  Lipoate-protein ligase A-like protein  22.86 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0776956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  27.46 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  21.28 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2325  hypothetical protein  23.23 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  21.28 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  21.28 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  20.45 
 
 		 230 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  21.28 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  27.78 
 
 		 236 aa  42.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  28.71 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>