48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3363 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  72.73 
 
 
283 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  65.31 
 
 
281 aa  381  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  64.1 
 
 
281 aa  381  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  65.31 
 
 
281 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  64.94 
 
 
281 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  64.58 
 
 
281 aa  378  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  64.94 
 
 
281 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  64.94 
 
 
281 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  64.94 
 
 
281 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  64.94 
 
 
281 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  64.58 
 
 
281 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  64.58 
 
 
281 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  54.65 
 
 
278 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  54.65 
 
 
278 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  53.7 
 
 
279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  38.74 
 
 
282 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  40.54 
 
 
274 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.8 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10550  lipoate-protein ligase A  26.98 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.38 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  27.5 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  29.11 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  28.93 
 
 
236 aa  55.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  24.64 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  24.14 
 
 
231 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  24.14 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  28.95 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  33.03 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  24.46 
 
 
232 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  24.39 
 
 
227 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  25.16 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  23.49 
 
 
234 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  27.35 
 
 
227 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0211  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0186526  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.94 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5000  Lipoate-protein ligase A-like protein  24 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0776956  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2325  hypothetical protein  28.82 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  22.15 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  22.15 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  25.28 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  22.15 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.42 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.42 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  26.44 
 
 
230 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.73 
 
 
329 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4582  Lipoate-protein ligase A-like protein  21.18 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>