51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4780 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  94.44 
 
 		 234 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  93.16 
 
 		 234 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  93.16 
 
 		 234 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  69.16 
 
 		 232 aa  325  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  67.53 
 
 		 231 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  64.94 
 
 		 231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  56.44 
 
 		 227 aa  224  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  56.44 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  33.04 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.87 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  30.7 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  34.38 
 
 		 258 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  30.36 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  28.7 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  31.05 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  34.44 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  28.49 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  29.73 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  25 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.69 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0393  Lipoate-protein ligase A-like protein  30.68 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  24.83 
 
 		 281 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  24.83 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.56 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.49 
 
 		 278 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  23.65 
 
 		 281 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.16 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0211  hypothetical protein  34.96 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  23.65 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.65 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  22.97 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2325  hypothetical protein  30.51 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  28.4 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  28 
 
 		 325 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.83 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2112  hypothetical protein  28.72 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  25.29 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.71 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  21.14 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  21.14 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  29.81 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  21.28 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  22.06 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.22 
 
 		 329 aa  42.4  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0058  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.68 
 
 		 260 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>