57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4853 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  92.07 
 
 		 227 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  57.43 
 
 		 234 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  57.92 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  58.25 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  57.92 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  54.55 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  56.44 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  53.43 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  35.16 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  40.45 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  33.17 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  111  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  32.67 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  41.49 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.87 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  35.22 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5553  hypothetical protein  39.68 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  34.18 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.11 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.25 
 
 		 254 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.14 
 
 		 283 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  29.66 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  29.66 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  24.31 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  30.77 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  27.04 
 
 		 334 aa  54.3  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.41 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  25.35 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  25.35 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.35 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  25.35 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  25.35 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.37 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.39 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  25.35 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  25.35 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  25.35 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  25.35 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  25.35 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.22 
 
 		 326 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  26.28 
 
 		 326 aa  52.8  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  26.05 
 
 		 279 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0211  hypothetical protein  33.56 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  27.45 
 
 		 334 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  30.77 
 
 		 325 aa  48.5  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.25 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0393  Lipoate-protein ligase A-like protein  30.12 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.42 
 
 		 329 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4582  Lipoate-protein ligase A-like protein  34.41 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  29.85 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2112  hypothetical protein  30.25 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.3 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  27.67 
 
 		 331 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  31.54 
 
 		 332 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  27.19 
 
 		 334 aa  42.4  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  27.33 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>