36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2325 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2325  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  497  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  75.21 
 
 
247 aa  360  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10550  lipoate-protein ligase A  52.86 
 
 
256 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4582  Lipoate-protein ligase A-like protein  48.15 
 
 
261 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  43.33 
 
 
233 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5000  Lipoate-protein ligase A-like protein  40.78 
 
 
245 aa  121  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0776956  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2112  hypothetical protein  36.96 
 
 
269 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0393  Lipoate-protein ligase A-like protein  34.23 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.5 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.04 
 
 
237 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0211  hypothetical protein  32.28 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0186526  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0058  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.53 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.73 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.76 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  27.66 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  26.76 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  27.66 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  27.94 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  27.66 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  27.66 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  27.66 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  27.66 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  26.76 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.21 
 
 
281 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.82 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.09 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  30.51 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  26.35 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.27 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  31.82 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  27.78 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  23.23 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  23.75 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  23.75 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  31.17 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  31.17 
 
 
234 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>