29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0058 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0058  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 260 aa  490  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  49.59 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  37.17 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0393  Lipoate-protein ligase A-like protein  38.5 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2112  hypothetical protein  38.31 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5000  Lipoate-protein ligase A-like protein  34.76 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0776956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0211  hypothetical protein  37.44 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.89 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  34.04 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2325  hypothetical protein  33.53 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522837  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4582  Lipoate-protein ligase A-like protein  35 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10550  lipoate-protein ligase A  33.87 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115999  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.29 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.62 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.04 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  29.73 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  30.41 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  23.21 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  30.77 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  29.68 
 
 		 234 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.08 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  30.18 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  30.18 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  23.62 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  29.51 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  29.59 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  26.92 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  27.87 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  27.55 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>