36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0393 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0393  Lipoate-protein ligase A-like protein  100 
 
 
243 aa  465  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2112  hypothetical protein  65.7 
 
 
269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  55.6 
 
 
237 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0211  hypothetical protein  51.64 
 
 
233 aa  176  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0186526  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2325  hypothetical protein  34.23 
 
 
249 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  36.02 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.2 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  33.94 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5000  Lipoate-protein ligase A-like protein  38.38 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0776956  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0058  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.03 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4582  Lipoate-protein ligase A-like protein  34.36 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10550  lipoate-protein ligase A  32.07 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  33.54 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.66 
 
 
274 aa  58.5  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  30.68 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  31.25 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  30.68 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  30.68 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  28.17 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  26.85 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  26.85 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  26.85 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  26.85 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  26.17 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  26.85 
 
 
281 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  28.22 
 
 
231 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  26.85 
 
 
281 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  26.17 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  26.28 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.17 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  30.67 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.5 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.56 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  30.12 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  30.72 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.16 
 
 
278 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>