46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0225 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 274 aa  570  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  39.84 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  39 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.71 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  38.5 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  38.5 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  38.5 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  38.5 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  38.5 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  36.94 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  38.5 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.49 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.55 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  38 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  37.44 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  40.54 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  36.04 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  36.04 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  31.11 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.06 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  28.89 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  30.16 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10550  lipoate-protein ligase A  27.47 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  28.15 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  31.43 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.27 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  30.47 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  28.3 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  27.87 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.69 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0393  Lipoate-protein ligase A-like protein  29.66 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  27.05 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  31.78 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  26.56 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5000  Lipoate-protein ligase A-like protein  27.61 
 
 		 245 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0776956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  26.83 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  26.56 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  27.27 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  26.56 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  26.56 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0211  hypothetical protein  27.21 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2112  hypothetical protein  28.12 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2325  hypothetical protein  30.09 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  25.55 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  28.17 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5553  hypothetical protein  24.6 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>