33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4582 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4582  Lipoate-protein ligase A-like protein  100 
 
 
261 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  49.57 
 
 
247 aa  195  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2325  hypothetical protein  48.15 
 
 
249 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522837  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10550  lipoate-protein ligase A  48.48 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  44.55 
 
 
233 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5000  Lipoate-protein ligase A-like protein  41.56 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0776956  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2112  hypothetical protein  34.57 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.91 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0211  hypothetical protein  31.1 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0186526  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0393  Lipoate-protein ligase A-like protein  34.36 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.96 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0058  biotin/lipoate A/B protein ligase  35 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.64 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.65 
 
 
259 aa  52  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  20.09 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  33.1 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.18 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  23.98 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  32.41 
 
 
227 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  27.74 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  26.82 
 
 
232 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  20.78 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  21.33 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  20.78 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  27.81 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  29.2 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  20.78 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  20.78 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  20.78 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  20.78 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  20.78 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  20.35 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  28.7 
 
 
236 aa  42.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>