44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2127 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 237 aa  457  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0393  Lipoate-protein ligase A-like protein  56.03 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0211  hypothetical protein  50.21 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2112  hypothetical protein  46.7 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  38.83 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5000  Lipoate-protein ligase A-like protein  39.15 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0776956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  35.6 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2325  hypothetical protein  36.04 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.6 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4582  Lipoate-protein ligase A-like protein  34.91 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10550  lipoate-protein ligase A  36.09 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0058  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.89 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.06 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  32 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  30.33 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  31.06 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.43 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  32.64 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  31.43 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.94 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  28.06 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  28.06 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  30 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  32.03 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.54 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  29.13 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  25 
 
 		 281 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  29.94 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.43 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  25.38 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  25.38 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  25.38 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  25.38 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.38 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  30.32 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  25.38 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  25.38 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  30.32 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  25.38 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.93 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  30.54 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  24.62 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  21.93 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  25.69 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>