42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000615 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  81.62 
 
 		 236 aa  401  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  56.77 
 
 		 236 aa  281  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  56.19 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  35.16 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  32.84 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  34.76 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  36.13 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  32.86 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  33.04 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  33.04 
 
 		 234 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  32.88 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  31.05 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  32.43 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  31.19 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  35.14 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.1 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  32.04 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5553  hypothetical protein  31.76 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.22 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.93 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.87 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  23.03 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  23.03 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  24.24 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  26.85 
 
 		 331 aa  48.5  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  29.53 
 
 		 331 aa  48.5  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  25.68 
 
 		 281 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.32 
 
 		 281 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  21.48 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  25 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  23.02 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.35 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  25 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2127  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.69 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.84 
 
 		 327 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>