39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3049 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  486  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  53.33 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  33.18 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  32.84 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.26 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  32.97 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  35.22 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  29.47 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  31.05 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  31.05 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  31.35 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  31.05 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  30.53 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  29.18 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  29.61 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.79 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  32.93 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.16 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  31.93 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5553  hypothetical protein  27.36 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.5 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  29.67 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.94 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  31.76 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  31.76 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  31.76 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  31.76 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  31.76 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  31.76 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  31.76 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  31.76 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  31.76 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.59 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  27.96 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  27.96 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.88 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5000  Lipoate-protein ligase A-like protein  26.76 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0776956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>