24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5553 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5553  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  63.41 
 
 		 246 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  47.64 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  39.68 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  37.62 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  34.3 
 
 		 231 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  35.4 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  36.51 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  34.72 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  34.39 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  34.26 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  33.8 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.16 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  31.76 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  28.36 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  27.84 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  27.51 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  31.02 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  23.81 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0957  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.06 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  22.93 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.6 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  22.93 
 
 		 281 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.29 
 
 		 281 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>