24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3748 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  262  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  84.93 
 
 		 146 aa  226  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  90.98 
 
 		 133 aa  223  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  88.72 
 
 		 133 aa  216  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  83.84 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  72.79 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  71.43 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  70.75 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  67.18 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  53.54 
 
 		 133 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  50.44 
 
 		 120 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  38.16 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  42.75 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2416  hypothetical protein  42.27 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  41.6 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3304  hypothetical protein  58.75 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  32.72 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  46.24 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1040  hypothetical protein  40.74 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.527359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  42.11 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  34.75 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61180  hypothetical protein  37.8 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0670  hypothetical protein  40.31 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>