15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4001 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  200  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  88.57 
 
 		 120 aa  173  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  39.81 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1040  hypothetical protein  46.36 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.527359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  39.64 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  39.02 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  42.86 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  35.82 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  42.31 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  38.46 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  30.08 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  32.33 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  34.86 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>