17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3250 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  57.14 
 
 		 120 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  36.89 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  61.84 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  36.89 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1040  hypothetical protein  38.95 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.527359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  32.72 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  31.54 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  34.91 
 
 		 133 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  35.37 
 
 		 120 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  32.94 
 
 		 95 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  37.65 
 
 		 127 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  36.47 
 
 		 527 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4461  hypothetical protein  36.21 
 
 		 105 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>