15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1399 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  88.81 
 
 		 121 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  87.37 
 
 		 95 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1040  hypothetical protein  84.26 
 
 		 108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.527359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  47.62 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4461  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  42.75 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  41.67 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  38.46 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  28.99 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  36.28 
 
 		 120 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  57.58 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  35.82 
 
 		 105 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0670  hypothetical protein  48.72 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156422 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  37.29 
 
 		 349 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>