13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0670 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  310  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  37.72 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  47.86 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  43.33 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  35.15 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  39.58 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  37.58 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  37.42 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  37.67 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  36.13 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5706  hypothetical protein  44.57 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  37.82 
 
 		 135 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>