19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4858 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  303  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  96.97 
 
 		 165 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  95.76 
 
 		 165 aa  270  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  88.46 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  69.57 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  68.32 
 
 		 146 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  66.05 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  64.2 
 
 		 133 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  64.57 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  47.59 
 
 		 133 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  49.59 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  40.37 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3304  hypothetical protein  63.64 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0670  hypothetical protein  38.78 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0933  hypothetical protein  27.78 
 
 		 586 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2416  hypothetical protein  44.76 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40581  predicted protein  34.85 
 
 		 517 aa  44.3  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.365172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  39.31 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>