21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3134 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  236  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  74.14 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  47.97 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  50.88 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  50.44 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  61.9 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  45.45 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  50.88 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  50.88 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  50.88 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  36.28 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  36.04 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  39.64 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  40.68 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  52.58 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3304  hypothetical protein  57.14 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1040  hypothetical protein  36.54 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.527359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  49.23 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  35.16 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  34.94 
 
 		 293 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  26.77 
 
 		 154 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>