17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4650 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  90.77 
 
 
165 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  88.46 
 
 
165 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  87.69 
 
 
165 aa  203  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  67.18 
 
 
146 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  64.89 
 
 
133 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  64.89 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  69.83 
 
 
127 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  62.6 
 
 
133 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  46.77 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3304  hypothetical protein  62.34 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  44.6 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  37.42 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40581  predicted protein  55.29 
 
 
517 aa  61.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.365172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0670  hypothetical protein  37.76 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.156422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  40.69 
 
 
168 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  40.44 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>