23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0565 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5706  hypothetical protein  52.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  38.16 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  41.67 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  38.82 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  40.68 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  34.21 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2088  hypothetical protein  64 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  34.34 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0670  hypothetical protein  41.32 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  37.41 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4461  hypothetical protein  30 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  36.73 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  36.05 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  38.89 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1040  hypothetical protein  36.54 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.527359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  33.62 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  47.06 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  36.08 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  37.42 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  34.86 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  26.77 
 
 		 120 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>