16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2277 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  247  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  83.84 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  76.19 
 
 		 133 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  77.55 
 
 		 133 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  74.75 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  64.84 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  64.57 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  78.57 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  86.05 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  63.44 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  61.9 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3304  hypothetical protein  66.2 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  54.41 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2416  hypothetical protein  42.47 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  36.08 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  37.65 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>