14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3304 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3304  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  236  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  55.56 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  56.84 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  66.23 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  53.47 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  62.34 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  63.64 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  63.64 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  57.65 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  66.2 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  43.86 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  57.14 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3306  hypothetical protein  30.95 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>