21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3548 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  243  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  91.73 
 
 		 133 aa  223  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  88.72 
 
 		 146 aa  216  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  77.44 
 
 		 146 aa  192  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  77.55 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  76.42 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  74.8 
 
 		 165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  73.98 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  53.97 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  62.6 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  47.97 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3304  hypothetical protein  65.85 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2416  hypothetical protein  43.4 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  38.82 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  31.54 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  34.11 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  54.55 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  38.38 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  30.08 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0670  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61180  hypothetical protein  36.29 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>