22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3162 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  270  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  84.93 
 
 		 146 aa  226  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  80.45 
 
 		 133 aa  201  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  77.44 
 
 		 133 aa  192  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  70.07 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  70.07 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  69.5 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  74.75 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  61.83 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  46.83 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3304  hypothetical protein  59.14 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  45.45 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  37.66 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2416  hypothetical protein  43.3 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  38.98 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  47.31 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  38.46 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0670  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61180  hypothetical protein  34.96 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2269  hypothetical protein  30.93 
 
 		 345 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.802243  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>