More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1575 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1575  FlhB domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3395  FlhB domain-containing protein  80.81 
 
 		 107 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3637  FlhB domain protein  79.8 
 
 		 107 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  73.53 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  73.53 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45410  FlhB domain-containing protein  80.46 
 
 		 111 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3854  flagellar biosynthetic FlhB domain-containing protein  83.13 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  70.41 
 
 		 114 aa  136  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2793  flagellar protein FhlB-like protein  72.16 
 
 		 114 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.231466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3898  hypothetical protein  69.07 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  56.7 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  55.56 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3039  FlhB domain-containing protein  54.32 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1808  flagellar protein FhlB-like protein  48.45 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  47.73 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1393  FlhB domain-containing protein  49.43 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372355  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  50.62 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  50.62 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  48.78 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  46.59 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  46.59 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  46.59 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  46.59 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  43.96 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1864  flagellar protein FhlB-like protein  55.26 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.989751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  45.45 
 
 		 103 aa  83.6  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1353  FlhB domain-containing protein  47.62 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  45.45 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  45.45 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  46.07 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  45.45 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  49.35 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  45.57 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  45.98 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  42.7 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  40.45 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03076  uncharacterized C-terminal FlhB domain-containing protein  39.78 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  41.56 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  42.17 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  41.56 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  41.18 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.18 
 
 		 354 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  44.3 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  39.33 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  42.86 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  43.59 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.05 
 
 		 363 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.18 
 
 		 354 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0429  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  37.97 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.904356  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  37.35 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  37.35 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  38.75 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.25 
 
 		 359 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0759  flagellar biosynthesis  40.45 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  37.35 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.31 
 
 		 377 aa  67.8  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  40 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.53 
 
 		 350 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  34.09 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  44.74 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1547  flagellar protein FhlB-like protein  40.23 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.178027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3320  FlhB domain protein  42.5 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  35.71 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  40 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.86 
 
 		 357 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.05 
 
 		 381 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  45 
 
 		 354 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.47 
 
 		 351 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  36.47 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.87 
 
 		 384 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.7 
 
 		 360 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1370  FlhB domain-containing protein  42.31 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  40.74 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1343  flagellar biosynthetic protein-like protein  37.93 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  35.37 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.51 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.75 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  41.33 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.51 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.7 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.23 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.36 
 
 		 381 aa  62  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2015  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.53 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.59 
 
 		 373 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1749  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.86 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2893  flagellar related protein  39.22 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  35.9 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.37 
 
 		 350 aa  61.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  33.33 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0719  flagellar biosynthesis protein  36.25 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0524995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1359  type III secretion exporter  36.9 
 
 		 355 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.31 
 
 		 358 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2361  flagellar biosynthesis protein  44.59 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2594  type III secretion exporter  36.9 
 
 		 355 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1160  FlhB domain-containing protein  44.59 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.7 
 
 		 352 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24290  flagellar protein  42.31 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1121  FlhB domain-containing protein  44.59 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2498  type III secretion exporter  36.9 
 
 		 355 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0369  FlhB domain-containing protein  38.46 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>