More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1864 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1864  flagellar protein FhlB-like protein  100 
 
 
98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.989751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1575  FlhB domain-containing protein  55.26 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  47.62 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  50 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2793  flagellar protein FhlB-like protein  53.95 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.231466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  49.41 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3395  FlhB domain-containing protein  51.32 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3637  FlhB domain protein  51.32 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  51.9 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  47.56 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  52.63 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3854  flagellar biosynthetic FlhB domain-containing protein  51.32 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3039  FlhB domain-containing protein  50 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45410  FlhB domain-containing protein  51.32 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  51.95 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  51.95 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  41.86 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  46.15 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  41.86 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  41.86 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  44.44 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  50.67 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1808  flagellar protein FhlB-like protein  52.63 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  47.44 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  45.78 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.65 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  45.65 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3898  hypothetical protein  50.62 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230986  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0138  FlhB domain-containing protein  43.04 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  46.05 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  44.71 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  42.86 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  44.83 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  47.3 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  47.44 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  40 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03076  uncharacterized C-terminal FlhB domain-containing protein  42.17 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1393  FlhB domain-containing protein  43.75 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372355  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  42.35 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  40.48 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  46.84 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  44 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  45.33 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  40.24 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  42.31 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  43.37 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  40.51 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.05 
 
 
366 aa  63.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  45.57 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  43.18 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  45.57 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  43.18 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  43.18 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0429  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  40 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.904356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1353  FlhB domain-containing protein  43.42 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  43.18 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  41.89 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  45.57 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  38.37 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  40.54 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  42.86 
 
 
87 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  47.14 
 
 
90 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.87 
 
 
350 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2029  flagellar protein FhlB-like protein  39.53 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00113086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  39.53 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1370  FlhB domain-containing protein  41.46 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  39.53 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5258  putative flagellar protein  44.74 
 
 
91 aa  60.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0170106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.15 
 
 
354 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.44 
 
 
352 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2369  flagellar protein FhlB-like protein  40.7 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1105  hypothetical protein  40.7 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.372697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3320  FlhB domain protein  38.64 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1991  hypothetical protein  44.58 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  46.75 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.49 
 
 
363 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3443  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.59 
 
 
324 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  40 
 
 
377 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0369  FlhB domain-containing protein  42.17 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2893  flagellar related protein  46.15 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5095  putative flagellar protein  41.86 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3056  putative flagellar protein FhlB  38.64 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.87 
 
 
380 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  41.03 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24290  flagellar protein  38.95 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  45.45 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.56 
 
 
360 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  44 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0976  flagellar protein FhlB-like protein  41.03 
 
 
92 aa  57.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.56 
 
 
350 aa  57  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1351  flagellar protein with uncharacterized cytoplasmic FhlB domain-like protein  40.48 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1160  FlhB domain-containing protein  41.33 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3161  FlhB domain-containing protein  41.98 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1343  flagellar biosynthetic protein-like protein  44.74 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1121  FlhB domain-containing protein  41.33 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111049  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.45 
 
 
361 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  42.17 
 
 
355 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  42.17 
 
 
356 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.74 
 
 
379 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3417  FlhB domain-containing protein  37.11 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>