More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4329 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  223  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  95 
 
 		 112 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  79.28 
 
 		 114 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3898  hypothetical protein  81.65 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3637  FlhB domain protein  78.22 
 
 		 107 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3395  FlhB domain-containing protein  78.22 
 
 		 107 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2793  flagellar protein FhlB-like protein  73.53 
 
 		 114 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.231466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1575  FlhB domain-containing protein  73.79 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45410  FlhB domain-containing protein  81.4 
 
 		 111 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3854  flagellar biosynthetic FlhB domain-containing protein  72.73 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  58.23 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1808  flagellar protein FhlB-like protein  49.48 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1393  FlhB domain-containing protein  48.94 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372355  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  47.78 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3039  FlhB domain-containing protein  52.27 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  48.78 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  48.89 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  46.67 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  46.67 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  46.67 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  53.25 
 
 		 82 aa  83.6  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  45.56 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  45.16 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1353  FlhB domain-containing protein  47.19 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  46.84 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  45.74 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  45.74 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03076  uncharacterized C-terminal FlhB domain-containing protein  43.16 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  41.49 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  45.16 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  48.15 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  44.44 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  47.56 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  43.48 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.13 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1864  flagellar protein FhlB-like protein  50 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.989751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  43.75 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  43.02 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  44.19 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  41.38 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.57 
 
 		 354 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  43.75 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  38.55 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  38.55 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.83 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  44.16 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  38.55 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.05 
 
 		 366 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  47.44 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  40 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  39.53 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  35.71 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  41.38 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  47.5 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  40.91 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.2 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.91 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.38 
 
 		 352 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  35.8 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0976  flagellar protein FhlB-like protein  39.76 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1749  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.43 
 
 		 359 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.18 
 
 		 357 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3320  FlhB domain protein  45 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.97 
 
 		 351 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.27 
 
 		 387 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2594  type III secretion exporter  41.67 
 
 		 355 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.27 
 
 		 387 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1359  type III secretion exporter  41.67 
 
 		 355 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2498  type III secretion exporter  41.67 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116579  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1547  flagellar protein FhlB-like protein  41.25 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.178027  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1760  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  43.02 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000598623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.29 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.87 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3905  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.25 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2893  flagellar related protein  37.93 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0429  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  37.18 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.904356  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0138  FlhB domain-containing protein  37.04 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1370  FlhB domain-containing protein  43.59 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.86 
 
 		 363 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  37.18 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  41.67 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  35.63 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  45 
 
 		 357 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  40.24 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.08 
 
 		 392 aa  61.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3417  FlhB domain-containing protein  39.18 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.59 
 
 		 384 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.24 
 
 		 354 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0369  FlhB domain-containing protein  44.16 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0778  flagellar biosynthetic protein  45.45 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  42.67 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3443  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.75 
 
 		 324 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4161  flagellar biosynthesis protein  41.76 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  40.48 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  41.56 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.61 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  32.47 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>