More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0368 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0368  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 429 aa  862    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0281  argininosuccinate lyase  72.94 
 
 		 429 aa  633  1e-180  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.456736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0971  argininosuccinate lyase  71.1 
 
 		 429 aa  625  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0231153  unclonable  0.000000000000187264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1832  argininosuccinate lyase  73.88 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.784813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0766  argininosuccinate lyase  43.5 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0160567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1988  argininosuccinate lyase  39 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.415578  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1701  argininosuccinate lyase  40 
 
 		 444 aa  279  9e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0263  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0999182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  35.11 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  34.93 
 
 		 459 aa  209  8e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  31.95 
 
 		 492 aa  202  7e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  35.42 
 
 		 487 aa  201  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  31.63 
 
 		 491 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  31.45 
 
 		 481 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  32.43 
 
 		 462 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  32.18 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  34.61 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  34.22 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  31.75 
 
 		 478 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1763  argininosuccinate lyase  34.48 
 
 		 501 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  32.2 
 
 		 467 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  34.51 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  35.08 
 
 		 502 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  32.29 
 
 		 468 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  31.99 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0330  argininosuccinate lyase  33.57 
 
 		 554 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  31.64 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  32.29 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1728  argininosuccinate lyase  31.45 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.365452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  32.06 
 
 		 469 aa  186  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  32.28 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  34.29 
 
 		 488 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  33.16 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  29.59 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  36.34 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  31.2 
 
 		 474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  31.1 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  32.54 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  32.63 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  32.02 
 
 		 472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  31.1 
 
 		 463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  32.29 
 
 		 489 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  32.84 
 
 		 463 aa  183  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  31.68 
 
 		 491 aa  183  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  31.28 
 
 		 463 aa  183  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  31.1 
 
 		 462 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  30.83 
 
 		 462 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 465 aa  182  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  30.83 
 
 		 462 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  31.1 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  32.01 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  31.1 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  31.88 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  31.88 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  31.88 
 
 		 490 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  32.03 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  31.88 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  32.85 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  31.99 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  31.88 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  31.88 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  34.2 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  31.75 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  32.03 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  31.88 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  31.23 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  32.03 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  29.4 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  31.2 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  28.88 
 
 		 459 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  31.88 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  36.16 
 
 		 462 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  30.83 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  30.19 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0533  argininosuccinate lyase  28.97 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  31.51 
 
 		 469 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  32.12 
 
 		 468 aa  180  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0013  argininosuccinate lyase  33.77 
 
 		 472 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 		 493 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  30.97 
 
 		 472 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  34.29 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  32.65 
 
 		 467 aa  179  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  31.65 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00121  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 		 470 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  32.8 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  30.65 
 
 		 469 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  31.22 
 
 		 462 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  30.83 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  30.29 
 
 		 462 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  27.37 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  31.25 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  27.21 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  30.11 
 
 		 469 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  31.65 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  31.73 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>