More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0281 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0971  argininosuccinate lyase  73.54 
 
 
429 aa  662    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0231153  unclonable  0.000000000000187264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1832  argininosuccinate lyase  84.15 
 
 
429 aa  700    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.784813  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0281  argininosuccinate lyase  100 
 
 
429 aa  873    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.456736  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0368  argininosuccinate lyase  72.94 
 
 
429 aa  632  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0766  argininosuccinate lyase  42.55 
 
 
450 aa  343  4e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0160567  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1701  argininosuccinate lyase  40.49 
 
 
444 aa  294  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1988  argininosuccinate lyase  39.14 
 
 
448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.415578  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  35.81 
 
 
494 aa  219  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  33.71 
 
 
468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0263  argininosuccinate lyase  34.38 
 
 
485 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0999182 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  31.49 
 
 
492 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  32.47 
 
 
474 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  31.82 
 
 
492 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
481 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  30.9 
 
 
493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  32.52 
 
 
462 aa  199  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  33.94 
 
 
476 aa  199  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  34.4 
 
 
459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  32.8 
 
 
459 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  33.78 
 
 
462 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  33.78 
 
 
462 aa  196  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
463 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
462 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
462 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 
491 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
462 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
462 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
463 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
462 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  32.06 
 
 
465 aa  192  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
462 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  32.23 
 
 
461 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  32.04 
 
 
469 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  32.99 
 
 
461 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  31.9 
 
 
464 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  31.39 
 
 
469 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  33.78 
 
 
487 aa  190  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  32.38 
 
 
467 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
463 aa  189  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  32.23 
 
 
468 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  31.63 
 
 
491 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  33.16 
 
 
467 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  32.23 
 
 
499 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  32.35 
 
 
464 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  32.23 
 
 
464 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  32.16 
 
 
462 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  35.75 
 
 
497 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  30.71 
 
 
478 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  34.5 
 
 
491 aa  186  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
468 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  29.89 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  29.89 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  31.71 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  31.38 
 
 
467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  29.89 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  31.71 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  32.23 
 
 
464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  31.98 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  32.57 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  29.89 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  29.89 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  29.89 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  31.82 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  29.89 
 
 
457 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1763  argininosuccinate lyase  34.44 
 
 
501 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  31.89 
 
 
467 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0533  argininosuccinate lyase  28.75 
 
 
411 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  31.4 
 
 
458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  31.73 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  31.98 
 
 
464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  31.73 
 
 
464 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  32.38 
 
 
475 aa  183  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  33 
 
 
460 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 
490 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1009  argininosuccinate lyase  30.05 
 
 
460 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0621733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  31.9 
 
 
464 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  32.4 
 
 
490 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 
469 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 
489 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  31.41 
 
 
458 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  32.4 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  32.4 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  31.58 
 
 
458 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  32.4 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  32.28 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  32.4 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  32.4 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0557  argininosuccinate lyase  28.5 
 
 
411 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  31.9 
 
 
464 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  31.89 
 
 
462 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 
468 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 
469 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  29.2 
 
 
458 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  32.4 
 
 
469 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 
469 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  31.38 
 
 
462 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  31.69 
 
 
470 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  33.49 
 
 
459 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 
468 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  32.02 
 
 
458 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>