More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1988 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1988  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 448 aa  906    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.415578  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1701  argininosuccinate lyase  54.05 
 
 		 444 aa  482  1e-135  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0971  argininosuccinate lyase  41.57 
 
 		 429 aa  292  9e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0231153  unclonable  0.000000000000187264 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0368  argininosuccinate lyase  39 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0766  argininosuccinate lyase  37.05 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0160567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0281  argininosuccinate lyase  39.14 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.456736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1832  argininosuccinate lyase  37.68 
 
 		 429 aa  246  8e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.784813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  34.42 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  33.04 
 
 		 492 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  32.24 
 
 		 462 aa  229  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  31.12 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  31.14 
 
 		 481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  33.41 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  31.45 
 
 		 492 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  31.35 
 
 		 481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  30.91 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  31.13 
 
 		 487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  31.64 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1763  argininosuccinate lyase  30.02 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  32.53 
 
 		 491 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  31.82 
 
 		 502 aa  209  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  31.44 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  32.51 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0330  argininosuccinate lyase  30.06 
 
 		 554 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  31.76 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  33.93 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0263  argininosuccinate lyase  34.78 
 
 		 485 aa  205  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0999182 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1043  argininosuccinate lyase  32.4 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1504  argininosuccinate lyase  30.89 
 
 		 498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  30.48 
 
 		 458 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  30.26 
 
 		 458 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  30.31 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  31.96 
 
 		 487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0922  argininosuccinate lyase  32.96 
 
 		 487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.276542  hitchhiker  2.40757e-17 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  29.75 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  29.75 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  30.88 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  32.16 
 
 		 466 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  30.04 
 
 		 458 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  30.04 
 
 		 458 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  29.96 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  30.26 
 
 		 457 aa  196  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  32.71 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  28.54 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  34.28 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  33.15 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  29.39 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  31.2 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  32.63 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  31.2 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  29.54 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  32.85 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  30.04 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  31.71 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  31.71 
 
 		 462 aa  194  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  30.95 
 
 		 462 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  31.74 
 
 		 464 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0730  argininosuccinate lyase  33.02 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.410396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  30.95 
 
 		 462 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  29.29 
 
 		 465 aa  193  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  29.39 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  31.71 
 
 		 462 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  30.57 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  31.2 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  29.23 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  30.04 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  29.1 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  29.1 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  29.1 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  34.54 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  29.1 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  29.1 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  29.1 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  29.1 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  31.46 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  31.14 
 
 		 467 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  30.91 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1047  argininosuccinate lyase  31.67 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00526091  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1367  argininosuccinate lyase  34.35 
 
 		 460 aa  190  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  28.26 
 
 		 481 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2217  argininosuccinate lyase  33.78 
 
 		 458 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  30.68 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  26.9 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  30.26 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  26.9 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  31.2 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  31.06 
 
 		 475 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  31.55 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  32.27 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  28.54 
 
 		 491 aa  187  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  34.2 
 
 		 456 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  29.5 
 
 		 467 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  29.56 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  29.78 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  30.67 
 
 		 457 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  32.27 
 
 		 624 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1327  argininosuccinate lyase  30.71 
 
 		 466 aa  186  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  28.09 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1327  argininosuccinate lyase  32.49 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.456779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>