More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0808 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1640  S-adenosylmethionine synthetase  89.88 
 
 		 405 aa  742    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.269895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0672  S-adenosylmethionine synthetase  86.1 
 
 		 404 aa  706    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.017434  hitchhiker  0.00762172 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1547  S-adenosylmethionine synthetase  87.1 
 
 		 404 aa  715    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13194  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1641  S-adenosylmethionine synthetase  87.34 
 
 		 404 aa  719    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0922  S-adenosylmethionine synthetase  87.34 
 
 		 404 aa  717    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0808  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 405 aa  837    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2094  S-adenosylmethionine synthetase  86.6 
 
 		 404 aa  688    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387431  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1896  S-adenosylmethionine synthetase  56.78 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.359449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  60.54 
 
 		 396 aa  477  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  59.71 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  58.52 
 
 		 395 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  58.48 
 
 		 395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  58.48 
 
 		 395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  59.06 
 
 		 395 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  58.66 
 
 		 397 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  59.17 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  58.5 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  57.84 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  58.92 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4094  S-adenosylmethionine synthetase  58.12 
 
 		 416 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1489  S-adenosylmethionine synthetase  57.65 
 
 		 416 aa  458  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  58.62 
 
 		 396 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  55.37 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3400  S-adenosylmethionine synthetase  57.14 
 
 		 419 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  56.62 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  57.18 
 
 		 403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0271  S-adenosylmethionine synthetase  57.92 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  56.9 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  58.79 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  57.88 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3691  S-adenosylmethionine synthetase  57.45 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.191471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2688  S-adenosylmethionine synthetase  60.75 
 
 		 388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  57.58 
 
 		 381 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  57.49 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  57.84 
 
 		 402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  56.5 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  56.5 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  58 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  56.5 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  56.17 
 
 		 405 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  58.35 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  55.72 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  56.5 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  58 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  56.5 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  56.5 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  58 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  56.69 
 
 		 403 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  56.58 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  58.33 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  56.5 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  56.5 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 		 384 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  58 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  57.47 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  57.46 
 
 		 398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  57.72 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  55.39 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 		 384 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05975  putative S-adenosylmethionine synthetase  56.81 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  57.47 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  57.47 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  57.72 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  58.66 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  57.18 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  57.22 
 
 		 383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  57.47 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  56.25 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  56.96 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  56.17 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  57.72 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  55.64 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  55.64 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 382 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 382 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  55.64 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0449  S-adenosylmethionine synthetase  56.51 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0964102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  54.73 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  57.39 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  57.47 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  58.1 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0287  S-adenosylmethionine synthetase  55.34 
 
 		 408 aa  443  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  54.86 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  55.69 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  55.34 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  55.83 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  55.69 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  55.11 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  55.69 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  57.72 
 
 		 383 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  55.69 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  57.72 
 
 		 383 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  57.72 
 
 		 383 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>