More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3400 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3691  S-adenosylmethionine synthetase  80.52 
 
 		 417 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.191471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4094  S-adenosylmethionine synthetase  82.3 
 
 		 416 aa  693    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0271  S-adenosylmethionine synthetase  77.4 
 
 		 417 aa  649    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1489  S-adenosylmethionine synthetase  80.62 
 
 		 416 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3400  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 419 aa  861    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3203  S-adenosylmethionine synthetase  75 
 
 		 426 aa  631  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05975  putative S-adenosylmethionine synthetase  74.94 
 
 		 417 aa  624  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0449  S-adenosylmethionine synthetase  74.13 
 
 		 425 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0964102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1896  S-adenosylmethionine synthetase  68.84 
 
 		 429 aa  612  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.359449 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1641  S-adenosylmethionine synthetase  56.61 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0672  S-adenosylmethionine synthetase  57.14 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.017434  hitchhiker  0.00762172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1640  S-adenosylmethionine synthetase  56.44 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.269895 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0808  S-adenosylmethionine synthetase  57.14 
 
 		 405 aa  455  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0922  S-adenosylmethionine synthetase  57.14 
 
 		 404 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  53.01 
 
 		 406 aa  448  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1840  S-adenosylmethionine synthetase  54.37 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1547  S-adenosylmethionine synthetase  56.41 
 
 		 404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13194  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1771  S-adenosylmethionine synthetase  53.88 
 
 		 403 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  53.49 
 
 		 387 aa  441  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04686  S-adenosylmethionine synthetase  55.45 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2688  S-adenosylmethionine synthetase  57.55 
 
 		 388 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  51.98 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  51.98 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  53.48 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2094  S-adenosylmethionine synthetase  56.44 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387431  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  53.48 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  53.72 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  53.72 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  53.72 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 		 384 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  53.24 
 
 		 384 aa  435  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  53.72 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  53.72 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 		 384 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  53.72 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  53.24 
 
 		 384 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  55.58 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  52.13 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  50.93 
 
 		 395 aa  433  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  52.13 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  53.51 
 
 		 383 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  53.24 
 
 		 384 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  55.73 
 
 		 381 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  53.73 
 
 		 396 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  52.16 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  54.09 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  53.12 
 
 		 396 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  51.05 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0630  S-adenosylmethionine synthetase  54.46 
 
 		 403 aa  428  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.370099  normal  0.156733 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  54.27 
 
 		 388 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  51.44 
 
 		 385 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  56.33 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  51.81 
 
 		 396 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05530  S-adenosylmethionine synthetase  52.29 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  52.16 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  51.19 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  51.33 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  51.92 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  53.51 
 
 		 403 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  53.25 
 
 		 403 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  51.29 
 
 		 396 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  53.77 
 
 		 396 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  51.81 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  52.4 
 
 		 383 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  52.4 
 
 		 383 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  52.16 
 
 		 383 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  51.81 
 
 		 396 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0506  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 		 384 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000508675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  51.81 
 
 		 396 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  52.4 
 
 		 383 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  53.41 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  53.37 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  56.27 
 
 		 383 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  53.37 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  53.37 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  53.07 
 
 		 396 aa  418  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  49.88 
 
 		 399 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  51.92 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  50.35 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  51.92 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  52.76 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0549  S-adenosylmethionine synthetase  53.24 
 
 		 384 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000243541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  53.37 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  51.92 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  53.56 
 
 		 382 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  55.85 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  52.16 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  53.37 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  53.37 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  53.63 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  53.63 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07090  S-adenosylmethionine synthetase  52.53 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.905662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  52.37 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3042  S-adenosylmethionine synthetase  52.16 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.983396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>