More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1640 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0808  S-adenosylmethionine synthetase  89.88 
 
 		 405 aa  743    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2094  S-adenosylmethionine synthetase  84.12 
 
 		 404 aa  675    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1641  S-adenosylmethionine synthetase  86.85 
 
 		 404 aa  711    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0672  S-adenosylmethionine synthetase  85.36 
 
 		 404 aa  700    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.017434  hitchhiker  0.00762172 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1547  S-adenosylmethionine synthetase  83.62 
 
 		 404 aa  690    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13194  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1640  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 405 aa  838    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.269895 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0922  S-adenosylmethionine synthetase  85.11 
 
 		 404 aa  705    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  57.04 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  59.21 
 
 		 405 aa  478  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 396 aa  478  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  58.81 
 
 		 395 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  59.45 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  59.36 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  58.94 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  58.94 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  57.74 
 
 		 395 aa  474  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  57.74 
 
 		 395 aa  474  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  58.94 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  58.69 
 
 		 384 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  58.69 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  58.69 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  58.58 
 
 		 403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  58.69 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  58.44 
 
 		 384 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  58.69 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  58.58 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  56.79 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  57.35 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  58.69 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  58.69 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  58.69 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  58.94 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  58.69 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  58.69 
 
 		 384 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_002950  PG1896  S-adenosylmethionine synthetase  55.53 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.359449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 		 381 aa  464  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  57.84 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  58.4 
 
 		 383 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  57.68 
 
 		 384 aa  461  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  57.68 
 
 		 384 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  57.6 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  58.65 
 
 		 383 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  58.65 
 
 		 383 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  56.83 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  58.65 
 
 		 383 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  58.4 
 
 		 383 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  58.99 
 
 		 383 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  57.68 
 
 		 384 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  58.96 
 
 		 398 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  58.48 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  58.99 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  55.83 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  58.99 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  56.82 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  58.99 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  58.23 
 
 		 383 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  58.99 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  58.5 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  58.23 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  58.09 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  56.93 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  55.37 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  55.33 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  56.34 
 
 		 405 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  55.39 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4094  S-adenosylmethionine synthetase  56.97 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  58.69 
 
 		 384 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3905  S-adenosylmethionine synthetase  59.2 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000687531  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  55.09 
 
 		 406 aa  454  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3707  S-adenosylmethionine synthetase  59.45 
 
 		 383 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00568587  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  57.25 
 
 		 395 aa  455  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  56.3 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  58.23 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3400  S-adenosylmethionine synthetase  56.44 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  55.45 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  58.27 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  58.09 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  57.6 
 
 		 402 aa  457  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  56.19 
 
 		 396 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  57.29 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0271  S-adenosylmethionine synthetase  56.26 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  58.59 
 
 		 382 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1489  S-adenosylmethionine synthetase  56.81 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 		 390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0506  S-adenosylmethionine synthetase  59.7 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000508675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3691  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.191471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  54.9 
 
 		 399 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 382 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  54.34 
 
 		 395 aa  448  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  54.9 
 
 		 399 aa  448  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0287  S-adenosylmethionine synthetase  55.58 
 
 		 408 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 		 399 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  58.44 
 
 		 388 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 		 382 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  57.43 
 
 		 384 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>