More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2688 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2688  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
388 aa  781    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 
403 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 
403 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  62.3 
 
 
381 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 
393 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  62.53 
 
 
402 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  60.86 
 
 
395 aa  478  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  59.69 
 
 
396 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  61.74 
 
 
383 aa  474  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  60.51 
 
 
395 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  61.31 
 
 
395 aa  478  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
403 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 
396 aa  477  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  61.31 
 
 
395 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 
398 aa  471  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
384 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.48 
 
 
383 aa  472  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
384 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
399 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 
396 aa  474  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
384 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  61.17 
 
 
403 aa  471  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
384 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  61.88 
 
 
383 aa  472  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 
398 aa  471  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
384 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 
395 aa  472  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 
383 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 
395 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  61.64 
 
 
382 aa  474  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  61.42 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  61.74 
 
 
383 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1896  S-adenosylmethionine synthetase  62.47 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.359449 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  61.17 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  61.74 
 
 
383 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  60.99 
 
 
382 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  60.99 
 
 
382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  61.48 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  61.74 
 
 
383 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  61.74 
 
 
383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  60.76 
 
 
405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 
383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 
383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 
383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 
383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  61.42 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  61.13 
 
 
397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  61.74 
 
 
383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
384 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  61.94 
 
 
384 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 
389 aa  464  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  61.94 
 
 
384 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  59.95 
 
 
397 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  60.51 
 
 
405 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  60.95 
 
 
384 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  61.94 
 
 
384 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 
388 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  60.95 
 
 
383 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  60.94 
 
 
389 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  59.03 
 
 
395 aa  463  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  61.13 
 
 
395 aa  463  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
387 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  59.44 
 
 
396 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  60.81 
 
 
391 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  60.81 
 
 
391 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  58.79 
 
 
399 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  62.08 
 
 
388 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  59.35 
 
 
402 aa  461  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  60.46 
 
 
396 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  61.46 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  60.94 
 
 
389 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  58.64 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  60.73 
 
 
387 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2303  S-adenosylmethionine synthetase  61.88 
 
 
389 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  58.64 
 
 
393 aa  458  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  59.05 
 
 
402 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  59.63 
 
 
383 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  59.18 
 
 
396 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  63.19 
 
 
387 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0015  S-adenosylmethionine synthetase  58.75 
 
 
385 aa  456  1e-127  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>