35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03639 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  96.5 
 
 
714 aa  1320    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  100 
 
 
733 aa  1526    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  86.78 
 
 
715 aa  1187    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  91.83 
 
 
734 aa  1400    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  49.39 
 
 
674 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  46.22 
 
 
674 aa  522  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  46.47 
 
 
680 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  44.02 
 
 
728 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  44.59 
 
 
728 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  44.44 
 
 
746 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  43.73 
 
 
728 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  44.3 
 
 
746 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  43.65 
 
 
728 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  43.67 
 
 
746 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02456  hypothetical protein  96.2 
 
 
185 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  35.25 
 
 
729 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1695  Type V secretory pathway, adhesin AidA  39.2 
 
 
447 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  30.84 
 
 
716 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  30.62 
 
 
716 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  31.12 
 
 
797 aa  107  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0094  hypothetical protein  33.66 
 
 
241 aa  105  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.88303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  27.87 
 
 
746 aa  104  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  29.03 
 
 
753 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  29.09 
 
 
746 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  27.81 
 
 
770 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  29.25 
 
 
805 aa  98.2  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  27.3 
 
 
770 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  29.11 
 
 
731 aa  90.5  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  29.79 
 
 
783 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  28.06 
 
 
774 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  28.06 
 
 
774 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  29.41 
 
 
740 aa  80.9  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0533  hypothetical protein  56.36 
 
 
353 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1530  hypothetical protein  48.15 
 
 
354 aa  55.1  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.18114  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9529  hypothetical protein  46.3 
 
 
361 aa  54.3  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>