31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1250 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  100 
 
 
716 aa  1472    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  93.56 
 
 
716 aa  1358    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  32.52 
 
 
715 aa  303  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  31.42 
 
 
729 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  34.53 
 
 
674 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  35.93 
 
 
674 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  31.57 
 
 
714 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  31.84 
 
 
728 aa  295  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  33.97 
 
 
680 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  32.32 
 
 
728 aa  292  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  31.8 
 
 
746 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  31.61 
 
 
728 aa  283  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  31.37 
 
 
746 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  31.84 
 
 
728 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  31.75 
 
 
746 aa  280  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  31.48 
 
 
734 aa  261  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  30.84 
 
 
733 aa  257  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  30.27 
 
 
783 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  29.82 
 
 
731 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  28.13 
 
 
797 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  28.08 
 
 
805 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  31.17 
 
 
746 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  29.89 
 
 
746 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1695  Type V secretory pathway, adhesin AidA  28.54 
 
 
447 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  29.74 
 
 
753 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  30.34 
 
 
770 aa  124  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  30.27 
 
 
770 aa  124  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  27.38 
 
 
774 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  27.61 
 
 
774 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  28.16 
 
 
740 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0094  hypothetical protein  25.78 
 
 
241 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.88303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>