32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03643 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  100 
 
 
714 aa  1484    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  96.5 
 
 
733 aa  1320    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  89.51 
 
 
715 aa  1333    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  91.03 
 
 
734 aa  1249    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  50.07 
 
 
674 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  47.5 
 
 
674 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  47.59 
 
 
680 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  45.31 
 
 
728 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  45.99 
 
 
728 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  45.23 
 
 
728 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  45.07 
 
 
746 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  45.13 
 
 
746 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  45.37 
 
 
728 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  44.34 
 
 
746 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  35.54 
 
 
729 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  31.72 
 
 
716 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  31.57 
 
 
716 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1695  Type V secretory pathway, adhesin AidA  38.5 
 
 
447 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02456  hypothetical protein  96.3 
 
 
185 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  31.35 
 
 
797 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  30 
 
 
770 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  30.96 
 
 
805 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  33.33 
 
 
746 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  29.61 
 
 
770 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  29.03 
 
 
746 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  29.35 
 
 
753 aa  129  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  29.2 
 
 
731 aa  124  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  29.63 
 
 
783 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  28.99 
 
 
774 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  28.75 
 
 
740 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  28.61 
 
 
774 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0094  hypothetical protein  33.17 
 
 
241 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.88303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>