35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02459 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  91.03 
 
 
714 aa  1249    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  91.83 
 
 
733 aa  1400    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  86.34 
 
 
715 aa  1181    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  100 
 
 
734 aa  1525    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  49.08 
 
 
674 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  47.55 
 
 
680 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  46.53 
 
 
674 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  43.15 
 
 
728 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  43.35 
 
 
728 aa  485  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  43.58 
 
 
746 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  43.79 
 
 
728 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  43.37 
 
 
746 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  43.93 
 
 
746 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  43.58 
 
 
728 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02456  hypothetical protein  98.37 
 
 
185 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  35.06 
 
 
729 aa  330  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  31.48 
 
 
716 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  31.48 
 
 
716 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1695  Type V secretory pathway, adhesin AidA  38.12 
 
 
447 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0094  hypothetical protein  35.35 
 
 
241 aa  108  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.88303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  31.82 
 
 
797 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  28.32 
 
 
746 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  27.79 
 
 
770 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  28.67 
 
 
753 aa  101  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  27.84 
 
 
770 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  30.27 
 
 
805 aa  99.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  28.73 
 
 
746 aa  99.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  28.77 
 
 
731 aa  90.5  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  29.11 
 
 
783 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  29.93 
 
 
740 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  27.25 
 
 
774 aa  80.9  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  27.25 
 
 
774 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0533  hypothetical protein  56.36 
 
 
353 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1530  hypothetical protein  48.15 
 
 
354 aa  54.3  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.18114  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9529  hypothetical protein  46.3 
 
 
361 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>