29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5511 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  54.36 
 
 
731 aa  819    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  100 
 
 
783 aa  1627    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  51.25 
 
 
770 aa  796    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  51.06 
 
 
770 aa  794    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  36.89 
 
 
774 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  36.61 
 
 
774 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  37.41 
 
 
740 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  36.67 
 
 
805 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  36.02 
 
 
797 aa  363  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  32.12 
 
 
746 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  28.05 
 
 
753 aa  167  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  32.11 
 
 
746 aa  158  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  30.27 
 
 
716 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  29.88 
 
 
716 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  29.55 
 
 
715 aa  123  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  29.63 
 
 
714 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  27.86 
 
 
680 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  27.78 
 
 
746 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  27.69 
 
 
746 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  27.55 
 
 
746 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  26.3 
 
 
729 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  26.79 
 
 
728 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  27.84 
 
 
674 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  27.43 
 
 
728 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  26.39 
 
 
728 aa  110  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  27.18 
 
 
728 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  28.65 
 
 
674 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  29.79 
 
 
733 aa  89.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  29.11 
 
 
734 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>