32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02463 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  89.51 
 
 
714 aa  1333    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  86.78 
 
 
733 aa  1187    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  100 
 
 
715 aa  1488    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  86.34 
 
 
734 aa  1181    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  50.77 
 
 
674 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  48.48 
 
 
674 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  48.09 
 
 
680 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  45.05 
 
 
728 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  45.11 
 
 
728 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  45.18 
 
 
728 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  44.47 
 
 
746 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  44.55 
 
 
746 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  44.97 
 
 
728 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  44.02 
 
 
746 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  34.98 
 
 
729 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  32.66 
 
 
716 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  32.52 
 
 
716 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1695  Type V secretory pathway, adhesin AidA  38.64 
 
 
447 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02456  hypothetical protein  87.96 
 
 
185 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  31.61 
 
 
797 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  30.75 
 
 
770 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  30.91 
 
 
770 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  30.46 
 
 
805 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  34.59 
 
 
746 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  28.95 
 
 
746 aa  128  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  29.73 
 
 
753 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  29.55 
 
 
783 aa  124  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  30.48 
 
 
731 aa  124  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  28.93 
 
 
740 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  29.72 
 
 
774 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  29.34 
 
 
774 aa  117  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0094  hypothetical protein  34.8 
 
 
241 aa  110  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.88303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>