33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2743 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  100 
 
 
674 aa  1396    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  61.94 
 
 
674 aa  844    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  64.18 
 
 
680 aa  886    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  50.07 
 
 
714 aa  632  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  50.77 
 
 
715 aa  634  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  49.08 
 
 
734 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  49.39 
 
 
733 aa  558  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  45.97 
 
 
728 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  45.56 
 
 
728 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  45.34 
 
 
746 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  45.07 
 
 
746 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  45.4 
 
 
728 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  45.26 
 
 
728 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  44.79 
 
 
746 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  35.2 
 
 
729 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  34.53 
 
 
716 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  35.29 
 
 
716 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1695  Type V secretory pathway, adhesin AidA  40.91 
 
 
447 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0094  hypothetical protein  42.18 
 
 
241 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.88303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  35.32 
 
 
746 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  25.66 
 
 
753 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  30.52 
 
 
746 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  28.57 
 
 
740 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  27.62 
 
 
805 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  29.64 
 
 
770 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  29.69 
 
 
770 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  28.1 
 
 
797 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  28.65 
 
 
783 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  28.61 
 
 
774 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  28.12 
 
 
774 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
731 aa  101  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02456  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  100  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3230  hypothetical protein  31.13 
 
 
239 aa  49.7  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>