34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0205 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  100 
 
 
728 aa  1517    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  95.05 
 
 
728 aa  1438    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  92.43 
 
 
746 aa  1407    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  94.78 
 
 
728 aa  1446    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  99.45 
 
 
746 aa  1511    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  91.07 
 
 
728 aa  1395    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1695  Type V secretory pathway, adhesin AidA  99.53 
 
 
447 aa  887    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  95.47 
 
 
746 aa  1440    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  45.99 
 
 
714 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  45.18 
 
 
715 aa  552  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  44.32 
 
 
674 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  45.4 
 
 
674 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  44.92 
 
 
680 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  44.59 
 
 
733 aa  505  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  43.79 
 
 
734 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0094  hypothetical protein  87.39 
 
 
241 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.88303  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  33.47 
 
 
729 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  31.36 
 
 
716 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  30.97 
 
 
716 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3230  hypothetical protein  97.12 
 
 
239 aa  217  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  27.99 
 
 
805 aa  131  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  28.41 
 
 
797 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  26.97 
 
 
770 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  26.8 
 
 
770 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  27.5 
 
 
753 aa  114  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  28.42 
 
 
746 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  26.9 
 
 
731 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  27.43 
 
 
783 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  27.2 
 
 
740 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  27.43 
 
 
746 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02456  hypothetical protein  54.17 
 
 
185 aa  110  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  25.66 
 
 
774 aa  108  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  25.18 
 
 
774 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1704  Type V secretory pathway, adhesin AidA  91.18 
 
 
39 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>