34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0128 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  90.8 
 
 
728 aa  1388    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  95.31 
 
 
746 aa  1475    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  92.48 
 
 
746 aa  1444    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1695  Type V secretory pathway, adhesin AidA  92.74 
 
 
447 aa  835    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  100 
 
 
746 aa  1555    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  94.64 
 
 
728 aa  1442    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  94.78 
 
 
728 aa  1432    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  95.47 
 
 
728 aa  1441    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  45.13 
 
 
714 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  45.34 
 
 
674 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  44.47 
 
 
715 aa  551  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  42.45 
 
 
674 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  44.04 
 
 
680 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  44.3 
 
 
733 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  43.58 
 
 
734 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0094  hypothetical protein  86.04 
 
 
241 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.88303  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  33.51 
 
 
729 aa  333  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  30.89 
 
 
716 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  30.76 
 
 
716 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3230  hypothetical protein  96.15 
 
 
239 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  27.79 
 
 
805 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  28.64 
 
 
797 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  27.33 
 
 
770 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  27.55 
 
 
783 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  28.42 
 
 
746 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  27.19 
 
 
770 aa  114  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  27.75 
 
 
753 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  26.9 
 
 
731 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  27.43 
 
 
746 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02456  hypothetical protein  54.17 
 
 
185 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  26.88 
 
 
740 aa  107  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  26.24 
 
 
774 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  25.36 
 
 
774 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1704  Type V secretory pathway, adhesin AidA  91.18 
 
 
39 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>